MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017950	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855710
2	NC_017950	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	389855710
3	NC_017950	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	389855710
4	NC_017950	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	389855710
5	NC_017950	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855710
6	NC_017950	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
7	NC_017950	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855710
8	NC_017950	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855710
9	NC_017950	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855710
10	NC_017950	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855710
11	NC_017950	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855710
12	NC_017950	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	389855710
13	NC_017950	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	389855710
14	NC_017950	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855710
15	NC_017950	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	389855710
16	NC_017950	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855710
17	NC_017950	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855710
18	NC_017950	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
19	NC_017950	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	389855710
20	NC_017950	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
21	NC_017950	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	389855710
22	NC_017950	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	389855710
23	NC_017950	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855710
24	NC_017950	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	389855710
25	NC_017950	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	389855710
26	NC_017950	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	389855710
27	NC_017950	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	389855710
28	NC_017950	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	389855710
29	NC_017950	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855710
30	NC_017950	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855710
31	NC_017950	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	389855710
32	NC_017950	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
33	NC_017950	AT	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	389855711
34	NC_017950	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	389855711
35	NC_017950	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855711
36	NC_017950	AAG	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855711
37	NC_017950	ACAA	2	8	1957	1964	75 %	0 %	0 %	25 %	389855711
38	NC_017950	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855711
39	NC_017950	TGA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855711
40	NC_017950	TGT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855711
41	NC_017950	TC	3	6	2147	2152	0 %	50 %	0 %	50 %	389855711
42	NC_017950	GAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855711
43	NC_017950	TCT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
44	NC_017950	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
45	NC_017950	TTA	2	6	2258	2263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855711
46	NC_017950	TACC	2	8	2269	2276	25 %	25 %	0 %	50 %	389855711
47	NC_017950	ACCG	2	8	2282	2289	25 %	0 %	25 %	50 %	389855711
48	NC_017950	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855711
49	NC_017950	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
50	NC_017950	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
51	NC_017950	TGT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855711
52	NC_017950	ACTT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	0 %	25 %	389855711
53	NC_017950	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
54	NC_017950	GTCC	2	8	2588	2595	0 %	25 %	25 %	50 %	389855711
55	NC_017950	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
56	NC_017950	TA	4	8	2764	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	389855712
57	NC_017950	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855712
58	NC_017950	CATAT	2	10	2808	2817	40 %	40 %	0 %	20 %	389855712
59	NC_017950	AAAG	2	8	2826	2833	75 %	0 %	25 %	0 %	389855712
60	NC_017950	A	6	6	2884	2889	100 %	0 %	0 %	0 %	389855712
61	NC_017950	AGT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
62	NC_017950	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
63	NC_017950	TA	3	6	3064	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	389855712
64	NC_017950	AT	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	389855712
65	NC_017950	A	7	7	3204	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	389855712
66	NC_017950	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
67	NC_017950	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
68	NC_017950	T	6	6	3336	3341	0 %	100 %	0 %	0 %	389855712
69	NC_017950	AGT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
70	NC_017950	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855712
71	NC_017950	GAAG	2	8	3410	3417	50 %	0 %	50 %	0 %	389855712
72	NC_017950	TTA	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
73	NC_017950	TCT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855712
74	NC_017950	ATT	3	9	3557	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
75	NC_017950	GA	3	6	3577	3582	50 %	0 %	50 %	0 %	389855712
76	NC_017950	GTAT	2	8	3625	3632	25 %	50 %	25 %	0 %	389855712
77	NC_017950	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855712
78	NC_017950	TCA	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855713
79	NC_017950	AAG	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855713
80	NC_017950	TGT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855713
81	NC_017950	ATG	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855713
82	NC_017950	TTG	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855715
83	NC_017950	AAC	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855715
84	NC_017950	AATG	2	8	4149	4156	50 %	25 %	25 %	0 %	389855715
85	NC_017950	GAA	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855715
86	NC_017950	TGT	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855715
87	NC_017950	ATT	2	6	4248	4253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855715
88	NC_017950	ATT	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855715
89	NC_017950	CAG	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
90	NC_017950	TCG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855716
91	NC_017950	TGG	2	6	4484	4489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855716
92	NC_017950	TCA	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
93	NC_017950	AAAT	2	8	4617	4624	75 %	25 %	0 %	0 %	389855716
94	NC_017950	GTG	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855716
95	NC_017950	TGA	3	9	4677	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
96	NC_017950	TTG	2	6	4721	4726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855716
97	NC_017950	AG	3	6	4779	4784	50 %	0 %	50 %	0 %	389855716
98	NC_017950	CAA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855716
99	NC_017950	A	6	6	4811	4816	100 %	0 %	0 %	0 %	389855716
100	NC_017950	A	6	6	4868	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	389855716
101	NC_017950	GAA	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
102	NC_017950	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	389855716
103	NC_017950	GAC	2	6	4962	4967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
104	NC_017950	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
105	NC_017950	AGT	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
106	NC_017950	AGA	3	9	5100	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
107	NC_017950	CGA	2	6	5121	5126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
108	NC_017950	CTTG	2	8	5205	5212	0 %	50 %	25 %	25 %	389855716
109	NC_017950	CAG	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
110	NC_017950	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
111	NC_017950	CAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
112	NC_017950	ATG	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
113	NC_017950	GAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
114	NC_017950	CAT	2	6	5445	5450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
115	NC_017950	A	6	6	5625	5630	100 %	0 %	0 %	0 %	389855717
116	NC_017950	ATC	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855717
117	NC_017950	AAACA	2	10	5679	5688	80 %	0 %	0 %	20 %	389855717
118	NC_017950	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855717
119	NC_017950	AAGAT	2	10	5748	5757	60 %	20 %	20 %	0 %	389855717
120	NC_017950	A	6	6	5796	5801	100 %	0 %	0 %	0 %	389855717
121	NC_017950	TCTA	2	8	5802	5809	25 %	50 %	0 %	25 %	389855717
122	NC_017950	ATGA	2	8	5828	5835	50 %	25 %	25 %	0 %	389855717
123	NC_017950	TTA	2	6	5866	5871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855717
124	NC_017950	TAG	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855717
125	NC_017950	GAC	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855717
126	NC_017950	TGG	2	6	5959	5964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855717
127	NC_017950	TGTCT	2	10	6070	6079	0 %	60 %	20 %	20 %	389855717
128	NC_017950	GAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855717
129	NC_017950	GAT	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855717
130	NC_017950	AATC	2	8	6234	6241	50 %	25 %	0 %	25 %	389855718
131	NC_017950	TAT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855718
132	NC_017950	AAT	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855718
133	NC_017950	ATG	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
134	NC_017950	ATT	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855718
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136	NC_017950	GAT	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
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